Temiz oda sarf malzemelerinin geri dönüşümü genellikle iki yolu izler: yüksek-değere sahip ekipman ve panellerin sökülüp yeniden kullanılması ve eldivenler ve temiz oda mendilleri gibi düşük-değere sahip sarf malzemelerinin yeniden işlenmesi (temizlenmesi). Bu uygulamalarla kurumsal maliyetlerin düşürülmesi ve ISO14001 çevre standartlarına uyumun sağlanması amaçlanmaktadır.
Katı atıkların toplanma sıklığı temiz odanın üretim faaliyetlerine bağlıdır. Genellikle atıklar günde en az bir kez toplanır; ancak üretim yoğunsa ve büyük miktarda katı atık üretiyorsa, çöp kutularının taşmasını ve normal operasyonları aksatmasını önlemek için toplama sıklığının-günde ikiye kadar- arttırılması gerekebilir.
Küçük sarf malzemelerinin yeniden işlenmesi: Temiz oda eldivenleri, plastik kaplar ve temiz oda mendilleri gibi-biyolojik olarak parçalanmayan öğeler-{2}}profesyonel yeniden işleme yoluyla ESD özelliklerine ve temizliklerine kavuşturulabilir. Yeniden işlenen öğelerin kalitesi yeni ürünlere yaklaşarak satın alma maliyetlerinde önemli tasarruflar sağlıyor ve çevre kirliliğini azaltıyor.
Gazlı atık toplama sistemi sürekli çalışarak temiz odadaki gaz konsantrasyonlarını gerçek zamanlı olarak izler.
Tehlikeli gaz konsantrasyonlarının güvenlik standartlarını aşması durumunda sistem otomatik olarak toplama prosedürlerini başlatır,
gazlı atıkların derhal arıtılmasının ve iç mekan hava kalitesinin gerekli sınırlar içinde kalmasının sağlanması.
Katı atıkların toplanma sıklığı temiz odanın üretim faaliyetlerine bağlıdır. Genellikle atıklar günde en az bir kez toplanır; ancak üretim yoğunsa ve büyük miktarda katı atık üretiyorsa, çöp kutularının taşmasını ve normal operasyonları aksatmasını önlemek için toplama sıklığının-günde ikiye kadar- arttırılması gerekebilir.